首先，侵犯的客体不同。

非法吸收公众存款罪侵犯的是国家金融管理秩序，为单一客体；而集资诈骗罪侵犯的则是复杂客体，既侵犯了公私财产所有权，又侵犯了国家金融管理制度。

其次，客观方面表现不同。

非法吸收公众存款罪是未经中国人民银行批准，向社会不特定对象吸收资金，以或者不以吸收公众存款的名义，出具凭证，承诺在一定期限内还本付息，扰乱金融秩序的行为，具体包括两种情况：一种是没有吸收公众存款资质的个人或法人吸收公众存款，另一种是具有吸收公众存款资质的法人采用违法的方法吸收存款。集资诈骗罪客观方面表现为行为人使用诈骗的方法非法集资，数额较大以上的行为，本罪的客观方面需同时具备如下三个条件：

1.必须有非法集资行为；

2.集资是使用诈骗的方法实施的；

3.使用集资诈骗方法非法集资必须达到数额较大。

最后，主观要件不同。

非法吸收公众存款罪主观方面表现为故意，过失不构成本罪；集资诈骗罪主观方面表现为故意且以非法占有为目的。

另外，在司法实践中，由于两罪的社会危害性相差悬殊，因此在判处的刑罚上也有较大区别，犯集资诈骗罪，数额特别巨大并且给国家和人民利益造成特别重大损失的，可处无期徒刑或者死刑；而非法吸收公众存款罪的最高刑期为10年以下有期徒刑。